一、技术原理
WGS技术通过高通量测序平台,对样本的整个基因组进行测序。它能够检测包括单核苷酸多态性(SNPs)、插入和缺失(InDels)、拷贝数变异(CNVs)和结构变异(SVs)等在内的所有类型的遗传变异。
二、实验流程
Step1:提取基因组DNA
Step2:DNA片段化
Step3:文库构建
Step4:测序
Step5:数据质控
Step6:序列比对
Step7:变异检测
Step8:数据分析和解释
三、技术总结
确保DNA样品的质量和纯度,避免污染
测序全过程需要严格的质控,确保数据的准确性
选择合适的捕获探针和测序平台,保证覆盖度和测序深度
数据分析需要专业的生物信息学工具和经验丰富的分析师
四、样本要如何准备?
组织样本:组织量≥100 mg,干冰运输;
血液样本:样品需使用EDTA抗凝,体积≥10 mL,低温运输,长时间运输需要干冰;
FFPE样本:FFPE 组织块低温运输;
唾液样本:2-3 mL唾液,干冰运输;
DNA样本:体积≥20 μL,浓度≥50 ng/μL,低温运输。
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