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ChIP
【简介】
ChIP实验旨在通过特异性抗体识别和结合目标蛋白,共沉淀出与其互作的DNA,验证目标转录因子与特定DNA序列的结合及其位置,为研究蛋白-DNA相互作用提供实验依据。
详细内容 交付标准

一、技术原理 

    在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起,通过超声或酶处理将染色质切为小片段后,利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来。

二、实验流程

Step1:蛋白-DNA 交联

Step2:细胞裂解

Step3:通过消化或声处理剪切来进行染色质碎裂

Step4:使用特异性抗体进行免疫沉淀

Step5:清除 DNA 以进行下游分析

Step6:通过 PCR、qPCR、微阵列或 NGS 进行 DNA 分析

三、结果展示

chip.png

四、技术总结

根据不同的细胞类型和目标蛋白进行优化交联时间和甲醛浓度;

超声碎裂染色质的条件(如超声时间和功率)需根据实验需要调整;

使用前需验证抗体的特异性和亲和力,确保其能特异性识别目标蛋白而非特异性蛋白或背景信号;

免疫沉淀过程中,抗体和蛋白A/G磁珠的比例、孵育时间需要精确控制;

根据实验需求调整洗涤液的种类和次数,确保背景信号最小化。

五、样本要如何准备?

细胞样本:细胞数1×10^7个,可以是细胞液或细胞沉淀,干冰运输;

组织样本:组织量≥100 mg,干冰运输。

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R 实验原始下机数据

R 数据统计分析

R GraphPad作图

R 引物序列

R 实验结果报告


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