一、技术原理
在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起,通过超声或酶处理将染色质切为小片段后,利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来。
二、实验流程
Step1:蛋白-DNA 交联
Step2:细胞裂解
Step3:通过消化或声处理剪切来进行染色质碎裂
Step4:使用特异性抗体进行免疫沉淀
Step5:清除 DNA 以进行下游分析
Step6:通过 PCR、qPCR、微阵列或 NGS 进行 DNA 分析
三、结果展示
四、技术总结
根据不同的细胞类型和目标蛋白进行优化交联时间和甲醛浓度;
超声碎裂染色质的条件(如超声时间和功率)需根据实验需要调整;
使用前需验证抗体的特异性和亲和力,确保其能特异性识别目标蛋白而非特异性蛋白或背景信号;
免疫沉淀过程中,抗体和蛋白A/G磁珠的比例、孵育时间需要精确控制;
根据实验需求调整洗涤液的种类和次数,确保背景信号最小化。
五、样本要如何准备?
细胞样本:细胞数1×10^7个,可以是细胞液或细胞沉淀,干冰运输;
组织样本:组织量≥100 mg,干冰运输。
R 高清原始图片
R 实验原始下机数据
R 数据统计分析
R GraphPad作图
R 引物序列
R 实验结果报告